Küresel Bir Kök Hücre Biyobankası için Test Alanı: Brezilya

Herhangi bir kökenden gelen bir kişinin kök hücre nakli için kemik iliği donörü bulabileceği herkes için bir biyobanka, kök hücre biliminin önemli bir hedefidir. Çoğu hasta için uygun olabilecek hücre dizileri depoları, Japonya ve Birleşik Krallık gibi genetik olarak homojen popülasyonlara sahip bazı ülkelerde başarıyla hayata geçirilirken, evrensel bir çözüm için daha kaç taneye ihtiyacımız olduğu bilinmiyor. Stem Cell Reports dergisinde 28 Eylül'de yayınlanan bir çalışmada araştırmacılar, Brezilya'nın daha çeşitli ve küresel temsili olan insanlarının %95'ini kapsamak için en az 559 farklı hücre dizisinin gerekli olacağını tahmin ediyor.

Rio de Janeiro Federal Üniversitesi'nden Antonio Carlos Campos de Carvalho ve Brezilya Sağlık Bakanlığı Ulusal Kardiyoloji Enstitüsü'nden Marcio Lassance Martins de Oliveira liderliğindeki araştırma ekibi, “Uyarılmış pluripotent kök (iPS) hücre bankalarından oluşan küresel bir ağ oluşturma olasılığını göz önünde bulundurarak, Brezilya'daki Afrika, Yerli ve Avrupalı ataların karışımı göz önüne alındığında, genetik çeşitliliğimizin diğer ülkeleri de kapsayabilecek iPS hücreleri sağlayabileceğini varsayıyoruz.” diyor.

Donör uyumluluğu, hastanın kök hücre naklini reddetme olasılığını azaltır. Ağır kan hastalıkları gibi organ naklinin gerekli olduğu durumlarda, kemik iliğini bağışlamayı ilk teklif edenler genellikle aile üyeleri oluyor, ancak akrabaların sadece %12'si uyumlu oluyor. Küresel bir biyobanka bu baskıları azaltabilir ancak kaç örneğin yeterli hücre dizisi çeşitliliği sağlayacağı bilinmiyor.

Brezilya'daki ideal sayıda donör hücre hattını bulmak için araştırma ekibi, Brezilya Ulusal Kemik İliği Donörleri Kayıt Defteri'nden (REDOME) elde edilen verileri kullandı. Araştırmacılar, 4 milyondan fazla birey arasından potansiyel evrensel bağışçı olarak hareket edebilecek yaklaşık 2.000 hücre hattını belirlediler. Ekip daha sonra bu hücre hatlarından kaçının Brezilya nüfusunun çoğuyla eşleşeceğini hesapladı ve 51, 157, 267 ve 559 hücre hattının, sırasıyla %50, %75, %85 ve %95 kapsama sağlayacağını tahmin etti. Ayrıca Brezilyalıların %99'unu kapsayacak şekilde 4 milyondan fazla kişinin test edilmesi gerekeceğini de öngördüler.

Özellikle Brezilyalıların neredeyse %40'ının donör eşleşmesi için yalnızca 30 hücre dizisi yeterliydi. Alel Frekans Net Veritabanını (AFND, dünya çapında 369 araştırmadan ve 10 milyondan fazla kişiden elde edilen genetik verileri derleyen) kullanan araştırmacılar, aynı 30 hücre hattının Kafkasyalıların yaklaşık %40'ını, Afrika soyundan gelenlerin %12'sini, Alaska'nın %25'ini kapsayabileceğini buldu.

Araştırmacılar, “Farklı popülasyonlar arasındaki bu farklılık, Brezilya'nın önemli ölçüde katkıda bulunabileceği bir Dünya iPS Bankası oluşturma girişiminin önemini gösteriyor.” diye ekliyorlar.